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真核生物中共有3种RNA聚合酶，其结构比大肠杆菌DNA聚合酶更复杂，它们在核中的位置不同，负责转录的基因不同，RNA聚合酶I定位于核仁，转录产物为rRNA；RNA聚合酶II，定位于核质，转录产物为mRNA；RNA聚合酶III，定位于核质，转录产物为tRNA。 RNA的转录有时是可以直接观察的。RNA聚合酶I催化的产物为rRNA的转录可见的，如南非爪蟾的卵母细胞中，有许多为rRNA编码的rRNA基因拷贝，这些基因必须很快的转录以保证受精后早期胚胎迅速生长和分裂所需的核糖体的生产。在这种细胞的电镜照片中可以见到许多弯曲的直径约为20nm的中心纤维，纤维上被覆盖着辐射状的细丝（每个片段约100根）。这些细丝是RNA的生长链，外面包有RNA细丝的中心纤维为重复的rRNA基因。所有这些基因都进行着活跃的转录。一个基因上同时进行多个转录过程，产生多个RNA链。每条RNA链不断延长。DNA分子上位于两侧RNA细丝基部位置的深色颗粒是DNA指导的RNA聚合酶分子。RNA聚合酶分子彼此非常靠近。在每一个RNA聚合酶分子从基因的一端移向另一端的过程中，它所生成的RNA链不断延长。进行转录的DNA片段为2—3m长。约等于真核细胞核糖体45SrRNA前体，编码所需长度、中心纤维中、未进行转录的片段是基因间隔区。如下图：真核生物工业生物RNA聚合酶的特性 注hnRNA为核内不均—RBA由mRNA的前体。
m长。约等于真核细胞核糖体45SrRNA前体，编码所需长度、中心纤维中、未进行转录的片段是基因间隔区。如下图：真核生物工业生物RNA聚合酶的特性
