D
解：①1mol甲基（-CH3）中含有9mol电子，所含的电子数为9NA，故①错误；
②0.2g氢气的物质的量为0.1mol，生成0.1mol氢气转移了0.2mol电子，根据电子守恒，则电路通过电子0.2NA，故②正确；
③5.6克铁粉的物质的量为0.1mol，0.1mol铁与足量硝酸反应失去0.3mol电子，硝酸不足，则反应生成亚铁离子，0.1mol铁失去0.2mol电子，所以反应失去的电子不一定是0.3NA，故③错误；
④常温常压下，16g O2和O3所含的氧原子的质量为16g，含有1mol氧原子，含有的原子数为NA，故④正确；
⑤1mol C10H22分子中含有9mol碳碳键、22mol碳氢键，总共含有31mol共价键，含有的共价键总数为31NA，故⑤正确；
⑥1mol Cl2发生反应时，如果与氢氧化钠溶液反应，氯气既是氧化剂也是还原剂，1mol氯气反应转移了1mol电子，转移的电子数一定是NA，故⑥错误；
⑦标况下水不是气体，不能使用标况下的气体摩尔体积计算22.4L水的物质的量，故⑦错误；
根据以上分析，正确的为：②④⑤，
故选D．
