C
解：∵f（x）是定义域在R上的奇函数，∴f（0）=0
f（x）以3为周期的函数，且f（2）=0，
∴f（5）=f（2）=0，f（3）=f（0）=0，f（-4））=f（-1）=f（2）=0
又∵f（x）是奇函数，∴f（4）=-f（-4）=0，f（1）=-f（-1）=0
∵f（x）是奇函数，还可得到f（-1.5）=-f（1.5），再∵f（x）以3为周期的函数，∴f（-1.5）=f（1.5）
∴-f（1.5）=f（1.5），∴f（1.5）=0，∴f（4.5）=f（1.5）=0
∴在（0，6）内满足f（x）=0的x的个数最少为7个，
故选C
